Pea enation mosaic virus (PEMV, вирус деформирующей мозаики гороха).
PEMV – РНК-вирус; не имеет ДНК-стадии. Его геном представлен двумя одноцепочечными смысловыми (кодирующими, плюс-цепями) РНК. Удивительно, но эти цепи, РНК-1 и РНК-2, негомологичны друг другу. Фактически PEMV представляет из себя симбиоз двух вирусов, PEMV-1 и PEMV-2, принадлежащих к разным родам.
PEMV-1 относится к группе лютеовирусов (Luteoviridae), к роду Enamovirus. PEMV-2 принадлежит к роду Umbravirus. PEMV-2 обеспечивает инфицирование растения при механическом внедрении в ткани и системное движение вируса по ним. PEMV-1 отвечает за капсидирование (образование и сборку капсида) и передачу вируса тлёй.
PEMV поражает растения семейства Бобовые, вызывая деформирующую мозаику гороха. Это заболевание проявляется в виде крапчатости, морщинистости и курчавости листьев и прилистников. На листьях образуются желтоватые пятна, которые в дальнейшем становятся белыми и слегка прозрачными. Специфическим и диагностическим признаком болезни является пролиферация (образование выпуклостей) с нижней стороны листьев. В дальнейшем пораженные участки отмирают, вследствие чего вдоль жилок на листовых пластинках заметны темно-коричневые полосчатые некротические пятна. Верхушечные листья растений обычно мелкие, недоразвитые. В случае раннего заражения происходят искривление и деформация бобов.
Вирус деформирующей мозаики гороха переносится несколькими видами тли (гороховая и персиковая тли).
Описание вируса PEMV-2.
PEMV-2 – РНК-вирус, геном закодирован одинарной плюс-цепью РНК, не имеет ДНК-стадии. При трансляции одного из белков PEMV-2, РНК-зависимой РНК-полимеразы (ген 1), задействован интересный механизм, называемый запрограммированным рибосомальным сдвигом рамки считывания (Ribosomal frameshifting). Он позволяет объединять фрагменты белка, закодированные в разных рамках считывания (у вирусов встречаются и не такие странности). Подробнее об этом механизме можно прочитать по ссылке http://viralzone.expasy.org/all_by_protein/860.html.
Описание генома PEMV-2 из записи банка RefSeq
- Идентификатор файла с геномом - NC_003853
- Содержание записи – последовательность полного генома вируса.
- Длина последовательности генома 4253 п.н.
- Кол-во генов равно 4.
Таблица 1. Гены в геноме PEMV2
Номер Обозначение № первого нуклеотида № последнего нуклеотида Направление Длина гена, п.н. 1 PEMV2gp1 (часть 1) 21
(часть 2)* 815
(часть 1) 815
(часть 2) 2560
прямое 2541 2 PEMV2gp2 21 929 прямое 909 3 PEMV2gp3 2763 3473 прямое 711 4 PEMV2gp4 2797 3549 прямое 753 * Рамка считывания сдвинута на 1 нуклеотид назад относительно начальной. См. рис.3
Pасположение генов относительно друг друга приведено на рис.1. Все гены находятся на одной цепи, причем гены с номерами 1 и 2, 3 и 4 пересекаются. Ген 2 находится внутри гена 1. Внутри гена 1 осуществляется переключение рамки считывания.
|
Рис.1 Структура генома PEMV2. (Изображение получено с помощью геномного браузера NCBI). Полноразмерное изображение можно открыть по щелчку в новой вкладке.  |
| Рис.2 Структура гена 1. Вертикальной чертой обозначено место сдвига рамки считывания.  |
| Рис.3 Место сдвига рамки считывания в гене 1.  |
| Рис.4. Начало генов 3 и 4.  |
 |
| Деформирующая мозаика гороха |
 |
| Гороховая тля - переносчик заболевания |
 |
| Вирион, типичный для энамовирусов, к которым принадлежит PEMV-1. Имеет около 25 нм в диаметре, капсид имеет икосаэдрическую симметрию и состоит из 120 белковых мономеров. Как вы помните, PEMV-2 не имеет своего капсида и вынужден "просить убежища" у PEMV-1. |
Ссылки:
PEMV-1 http://viralzone.expasy.org/viralzone/all_by_species/305.html
PEMV-2 http://viralzone.expasy.org/viralzone/all_by_species/645.html
Информация о PEMV http://www.dpvweb.net/dpv/showdpv.php?dpvno=372
Деформирующая мозаика гороха http://agroflora.ru/virusnye-zabolevaniya-goroxa