Учебный сайт Ивановой Софьи

Главная Первый семестр Второй семестр Ссылки Обо мне Контакты


После того, как структура загрузится, надо нажать две кнопки:

1. Запустить скрипт:

2. Продолжить исполнение скрипта:

Text of the script

Jmol output:


Протокол задания. 15.02.2014

С помощью апплета программы Jmol получено несколько изображений вышеуказанного белка, элементов его вторичной, третичной и четвертичной структуры.

Ниже представлена таблица с результатами выполнения задания 3. Средствами Jmol были измерены параметры трех водородных связей из вторичной структуры белка. Связь №1 из таблицы 1 связывает два бета-тяжа. Водородные связи №2 и 3 из данной таблицы формируют структуру альфа-спирали.


Таблица 1. Результаты измерения параметров водородный связей из вторичных структур белка.

№ связи атомы, обр-е связь длина связи, ангстрем угол между атомами N, O и C
N O
1 Ile 339:A Val 220:A 2.92 148.8°
2 Leu 387:B Ile 384:B 3.07 109.8°
3 His 385:B Phe 381:B 2.82 163.7°

В колонке 2 указан номер, тип и принадлежность к определенной белковой цепи аминокислотного остатка, к которому принадлежит атом, образующий данную водородную связь; в колонке три указана длина связи, в столбце 4 - угол между атомами N, O и C, с которым связан O.