Поиск мотивов в последовательности RL25_ECOLI с помощью средств PROSITE


Работа с прoграммой:

  1. Internet Explorer




В базе данных PROSITE собрана коллекция сайтов, мотивов и доменов. Они описаны с помощью паттернов (раннее в базе данных использовались только они) и профилей-PSSM (теперь это основная форма описания).


С помощью программы ScanProsite (Scan a protein for PROSITE matches) был найден 1 известный мотив в последовательности RL25_ECOLI.


Описание найденной записи:



* - отмечены часто встречающиеся в белках мотивы,
** - отмечены паттерны мотива, для которого в PROSITE есть еще и профиль (таковых нет).


Мотив RL25_ECOLI, соответствующий найденному паттерну: S-R-R.


Альтернативный паттерн, также идеально удовлетворяющий этому паттерну: T-A-K.



Главная страница