| Параметры водородных связей между остовными атомами во вторичной структуре | |||
|---|---|---|---|
| # | Имена атомов | Длина связи (Å) | Угол N-H-O (degrees) |
| Альфа-спираль | |||
| 1 | O(349GLN)-N(353LEU) | 2.92 | 169.9 |
| 2 | O(350VAL)-N(354ASN) | 2.96 | 165.1 |
| 3 | O(351ILE)-N(355LYS) | 3.05 | 136.9 |
| Бета-тяжи | |||
| 1 | N(319ARG)-O(334THR) | 2.83 | 157.0 |
| 2 | N(334THR)-O(319ARG) | 3.1 | 140.3 |
| 3 | N(321GLY)-O(332THR) | 2.99 | 152.7 |
По итогам измерений было получено, что средняя длина водородной связи равна 2.97Å. Средним значением по углам водородных связей является 153.6 градусов.
Как легко можно заметить, полученные результаты соответствуют тем данным, что можно найти в литературе. А именно средняя длина должна быть 2.7-3.1Å, а угол должен быть приближен к 180 градусам, что тоже очень близко к полученным результатам.