На рисунке слева изображена полученная с помощью ChemSketch схема тетрануклеотида TAGC. Красным выделен сахарофосфатный остов, фиолетовым – атомы азота оснований, участвующие в N-гликозидной связи. |
Cтруктуры уридина и псевдоуридина отличаются атомами, через которыми азотистые основания присоединяются к 1-му углероду рибозы и, соответственно, видом связи: у уридина – N-гликозидная, у псевдоуридина – гликозидная. Интересно: атомы оснований, образующие водородные связи в обоих случаях одинаковые. Поэтому можно предположить, что псевдоурацил будет связываться с основаниями так же, как урацил. |
|
Кроме того для пар "пурин-пиримидин" (A-T, G-C, A-C, G-T) были изображены возможные
взаимодействия (с помощью водородных связей). Сравнив полученные пары обозначили оптимальные неканонические пары
(с наибольшим количеством связей). В организме наиболее выгодны, конечно, канонические пары оснований, имеющие большее количесво связей
(между G и C их три). Но нельзя говорить, что неканонических взаимодействий между основаниями не бывает!
Эти взаимодействия могут играть важную роль в образовании третичной структуры РНК.
Результаты выполнения заданий практикума можно увидеть здесь
|