5RVB
Имена атомов | Длина связи (Å) | Угол N-H-O (°) |
Альфа-спирали | ||
N(166SER)-O(162ASP) | 2.88 | 160.1 |
N(165VAL)-O(161TYR) | 2.90 | 169.0 |
N(164LEU)-O(160LEU) | 2.84 | 158.7 |
N(163LYS)-O(159ASN) | 3.09 | 157.5 |
N(162ASP)-O(158LYS) | 2.89 | 160.7 |
Среднее | 2.92 | 161.2 |
Бета-листы | ||
N(155VAL)-O(019LYS) | 2.94 | 166.2 |
N(019LYS)-O(153LEU) | 2.92 | 140.7 |
N(153LEU)-O(017TYR) | 2.86 | 175.5 |
Среднее | 2.90 | 160.8 |
Вывод
Полученные средние значения не ялвяются идеальными, однако средняя длина и в альфа-спирали, и в бета-листе меньше 3.5Å (один из критериев образования водородной связи), и средние значения углов связей спиралей и листов отличаются от 180 градусов (идеального значения) менее, чем на 20 градусов, значит образуются водородные связи.
Источник
Jeffrey, George A.; An introduction to hydrogen bonding, Oxford University Press, 1997