ЗАПИСИ В БД И КОМАНДЫ
PDB
2DTJ
3AAW
3AB2
3AB4
EMBL
X57226
X57226
BA000036
BX927148
X70959
Команды для поиска белков по uniprot.
Поиск любых записей о бактерии в базе uniprot по номеру таксона:
taxonomy:"Corynebacterium glutamicum (strain ATCC 13032 / DSM 20300 / BCRC 11384 / JCM 1318 / LMG 3730 / NCIMB 10025) [196627]"
Поиск записей о существующих белках в бактерии в базе uniprot:
taxonomy:"Corynebacterium glutamicum (strain ATCC 13032 / DSM 20300 / BCRC 11384 / JCM 1318 / LMG 3730 / NCIMB 10025) [196627]" existence:"Evidence at protein level [1]"
Поиск любых аспартат киназ:
name:"aspartate kinase"
Поиск аспартат киназ, кодируемых геном LysC:
name:"aspartate kinase" gene:lysc
Поиск аспартат киназ, кодируемых геном LysC, продукт которого имеет доказательства существования:
name:"aspartate kinase" gene:lysc existence:"Evidence at protein level [1]"
Команды для поиска по протеомам.
Трансмембранные белки по Corynebacterium glutamicum:
annotation:(type:transmem) AND organism:"Corynebacterium glutamicum (strain ATCC 13032 / DSM 20300 / BCRC 11384 / JCM 1318 / LMG 3730 / NCIMB 10025) [196627]" AND proteome:up000000582
Трансмембранные белки по Bacillus subtilis:
annotation:(type:transmem) AND organism:"Bacillus licheniformis (strain ATCC 14580 / DSM 13 / JCM 2505 / NBRC 12200 / NCIMB 9375 / NRRL NRS-1264 / Gibson 46) [279010]" AND proteome:up000000606
Ферменты по Corynebacterium glutamicum:
ec:* AND organism:"Corynebacterium glutamicum (strain ATCC 13032 / DSM 20300 / BCRC 11384 / JCM 1318 / LMG 3730 / NCIMB 10025) [196627]" AND proteome:up000000582
Ферменты по Bacillus subtilis:
ec:* AND organism:"Bacillus licheniformis (strain ATCC 14580 / DSM 13 / JCM 2505 / NBRC 12200 / NCIMB 9375 / NRRL NRS-1264 / Gibson 46) [279010]" AND proteome:up000000606
pH-зависимые по Corynebacterium glutamicum:
annotation:(type:"ph dependence") AND organism:"Corynebacterium glutamicum (strain ATCC 13032 / DSM 20300 / BCRC 11384 / JCM 1318 / LMG 3730 / NCIMB 10025) [196627]" AND proteome:up000000582
pH-зависимые по Bacillus subtilis:
annotation:(type:"ph dependence") AND organism:"Bacillus licheniformis (strain ATCC 14580 / DSM 13 / JCM 2505 / NBRC 12200 / NCIMB 9375 / NRRL NRS-1264 / Gibson 46) [279010]" AND proteome:up000000606
Аспартат киназы по Corynebacterium glutamicum:
name:aspartokinase AND organism:"Corynebacterium glutamicum (strain ATCC 13032 / DSM 20300 / BCRC 11384 / JCM 1318 / LMG 3730 / NCIMB 10025) [196627]" AND proteome:up000000582
Аспартат киназы по Bacillus subtilis:
name:aspartokinase AND organism:"Bacillus licheniformis (strain ATCC 14580 / DSM 13 / JCM 2505 / NBRC 12200 / NCIMB 9375 / NRRL NRS-1264 / Gibson 46) [279010]" AND proteome:up000000606