|
|
- Царство Bacteria
- Тип Proteobacteria
- Класс Gammaproteobacteria
- Отряд Enterobacteriales
- Семейство Enterobacteriaceae
- Род Enterobacter
- Вид Enterobacter sp. 638
Enterobacter sp. 638 – это эндофитная бактерия, способствующая росту растения, которая была выделена из ствола тополя (Populus trichocarpaxdeltoides cv. H11-11), важного растения, т.к. оно используется в качестве биотоплива. Её геном состоит из 4 518 712 пар нуктеотидов в хромосомах и 157 749 пар нуклеотидов в плазмидах. Изучение генома этой бактерии позволило выяснить, что определенные гены специфичны для адаптации к данной экологической нише (т.е. в жизни именно в тополе). В них входят гены, которые кодируют белки, участвующие в выживании в ризосфере (т.е. необходимые для того, чтобы справляться оксидативным стрессом или для поглощения питательных веществ, проводимых корнями растения), в создании фимбрий, в поселении в растении-хозяине, в его защите от грибкового и бактериального заражения и в помощи растению в росте и развитии.
Анализ обмена веществ показал, что синтез ацетоина и 2,3-бутадиенола вызывается присутствием сахарозы в питательной среде. Интересно, что обе генетические детерминатны, необходимые для обмена сахарозы и синтеза ацетоина и 2,3-бутадиенола, сгруппированы на генетических островах. Эти находки указывают на близкое взаимодействие между Enterobacter sp. 638 и тополем, при котором доступность сахарозы, самого важного углевода для растения, влияет на синтез фитогормонов, необходимых для роста растения.
Наличие расшифрованного генома, в сочетании с анализами метаболома и транскриптома, обеспечит лучшее понимание синергетического взаимодействия между тополем и способствующего его росту эндофита Enterobacter зр. 638. Эта информация может быть использована для дальнейшего улучшения и создания устойчивого производства тополя, как энергетического сырья на малодоходных сельскохозяйственных землях, используя эндофитные бактерии, как способствующих росту агентов.
Состав ДНК Enterobacter sp. 638:
| Компонент | Хромосома | Плазмида pENTE01 |
|---|---|---|
| Число белков | 4115 | 125 |
| Число генов | 4115 | 125 |
| Тип | Кольцевая | Кольцевая |
| Длина (пар нуклеотидов) | 4518712 | 157749 |
| Средняя длинаCDS(п.н.) | 964.231 | 974.424 |
| GС-content | 53% | 50,6% |
Источники:
Фотография
База данных Европейского института биоинформатики
Статья на PLOS Genetics
Статья на PubMed
Наверх
Enterobacter sp. 638
pENT638-1 Enterobacter sp. 638