Thymidine phosphorylase



  >typh_ecoli                                                  

thymidine phosphorylase MFLAQEIIRKKRDGHALSDEEIRFFINGIRDNTISEGQIAALAMT IFFHDMTMPERVSLTMAMRDSGTVLDWKSLHLNGPIVDKHSTGGVGDVTSLMLGPMVAA CGGYIPMISGRGLGHTGGTLDKLESIPGFDIFPDDNRFREIIKDVGVAIIGQTSSLAPA DKRFYATRDITATVDSIPLITASILAKKLAEGLDALVMDVKVGSGAFMPTYELSEALAE AIVGVANGAGVRTTALLTDMNQVLASSAGNAVEVREAVQFLTGEYRNPRLFDVTMALCV EMLISGKLAKDDAEARAKLQAVLDNGKAAEVFGRMVAAQKGPTDFVENYAKYLPTAMLT KAVYADTEGFVSEMDTRALGMAVVAMGGGRRQASDTIDYSVGFTDMARLGDQVDGQRPL AVIHAKDENNWQEAAKAVKAAIKLADKAPESTPTVYRRISE


    Мои вычисления с помощью Excel

Аминокислотный состав
A (аланин) 12.7%
C (цистеин) 0.5%
D (аспарагиновая к-та) 7.5%
E (глутаминовая к-та) 5.5%
F (фенилаланин) 3.6%
G (глицин) 8.9%
H (гистидин) 1.4%
I (изолейцин) 6.1%
K (лизин) 5%
L (лейцин) 8.2%
M (метионин) 4.5%
N (аспарагин) 2.7%
P (пролин) 3.4%
Q (глутамин) 2.5%
R (аргинин) 5.5%
S (серин) 5.2%
T (треонин) 6.6%
V (валин) 7.7%
W (триптофан) 0.5%
Y (тирозин) 2%

  • Длина последовательности: 440 а.о.    
  • Молярная масса: 47213
  • Относительное содержание гидрофобных(A,C,I,LM,F,V) и гидрофильных (S,K,H,E,Q,D,N,R) остатков в моем белке равно 0,65, в E.coli 1.10, в TC-2A 7,37 На основании этого нельзя сказать, что мой белок является мембранным - в его состав входит слишком мало гидрофобных аминокислотных остатков, которые в мембранном белке необходимы для нахождения в состоянии равновесия с гидрофобным бислоем липидов.
   



©KANANYKHINA EVGENIYA

НАЗАД

НА ГЛАВНУЮ