На главную страницу второго семестра

Банки данных swiss-Prot и UniProt

Данные банка Swiss-Prot о белке PHOQ_ECOLI

Информация Метка поля Запись
Внутренний уникальный постоянный идентификатор документа AC P23837
Стандартное имя последовательности (идентификатор последовательности) ID PHOQ_ECOLI
Название белка, отражающее его функции DE Sensor protein phoQ
Дата создания документа DT 01-NOV-1991
Дата последнего исправления аннотации DT 01-FEB-2005
Название организма OS Escherichia coli
Полное название таксона OC Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Enterobacteriales; Enterobacteriaceae; Escherichia
Длина последовательности ID,SQ 486 а.о.
Молекулярная масса белка MW 55300 а.е.м.
Число публикаций, использованных при создании документа RN 4
Название журнала с самой свежей публикацией RL Science (1997)" The complete genome sequence of Escherichia coli K-12."
Описание вторичной структуры FT Описание вторичной структуры есть, оно заключается в последовательном перечислении элементов вторичной структуры (α-спиралей, β-тяжей, доменов и поворотов), а также указаны номера аминокислот, входящих в состав этих элементов и протяжённость элемента.
Содержание поля комментариев CC В комментариях указаны функция белка, его локализация в клетке, семейство белков, к которому относится данный белок, указаны авторские права на документ и возможность использования другими.
Особенности последовательности FT Указаны домены, α-спирали, β-тяжи, домены и повороты
Идентификатор файла PDB DR 1ID0

Более подробное описание белка PHOQ_Ecoli (и не только его) находится в банке данных Swiss-Prot

Результаты поиска в базе данных UniProt белков с тем же кратким описанием, что и у белка FHUA_ECOLI

Поиск производился с помощью поисковой системы SRS .

Таксон Запрос Количество найденных документов
Археи (Archaea) "(((([uniprot-Description:Sensor*] & [uniprot-Description:protein*]) & [uniprot-Description:phoQ*]) | [uniprot-Description:Sensor protein phoQ*]) & [uniprot-Taxonomy:Archaea*]) " 0
Бактерии (Bacteria) "(((([uniprot-Description:Sensor*] & [uniprot-Description:protein*]) & [uniprot-Description:phoQ*]) | [uniprot-Description:Sensor protein phoQ*]) & [uniprot-Taxonomy:Bacteria*]) " 19
Эукариоты (Eukaryota) "(((([uniprot-Description:Sensor*] & [uniprot-Description:protein*]) & [uniprot-Description:phoQ*]) | [uniprot-Description:Sensor protein phoQ*]) & [uniprot-Taxonomy:Eukaryota*]) " 0



© Низамутдинов Игорь, 2004