Информация банка EMBL о гене белка PHOQ_ECOLI

Задание 2 пр.6. Работа с документами банка EMBL.

В документе SwissProt, описывающем белок PHOQ_ECOLI, было найдено 4 ссылки на банк EMBL, были проанализированы 2 из них, соответствующие AC D90393 и D90748. Ниже приведена таблица, содержащая информацию, извлеченную из соответствующих документов банка EMBL.

	I	II
ID	ECPHOPQ	ECD748
AC	D90393	D90748
Тип молекулы	ДНК	ДНК
Длина последовательности в записи	4097	15007
Раздел банка	PRO	PRO
Начало гена в записи	1722	4550
Конец гена в записи	3182	6010
Направление гена	Прямое	Обратное
Дата последнего изменения документа	17 апреля 2005г.	17 апреля 2005г.
Примечания	"sensor protein"	1."ORF_ID:o239#2" 2. "similar to SwissProt Accession Number P29745"

Задание 3 пр.6. Сравнение двух генов одного белка

При помощи программы seqret из этих документов были извлечены участки нуклеотидных последовательностей, кодирующие белок Phoq_ecoli, начала и концы этих последовательностей были найдены в поле FT по AC, соответствующему исследуемому белку. Далее эти последовательности были сравнены при помощи програмы needle. Identity оказалось равным 100%