Доменная структура белка TolC

База данных PFAM включает 7426 записей с краткой характеристикой разных семейств белковых доменов, включая их множественные выравнивания. Каждый домен в PFAM описан с помощью профиля-НММ.

Согласно базе данных PFAM в белке TolC существует 4 домена.

Название домена Начальный остаток Конечный остаток Идентификатор записи Описание

OEP 27 и 233 211 и 429 PF02321 Белки этого семейства формируют трехмерные каналы: бета-тяжи во внешней мембране и альфа-спирали в периплазме. Эти каналы позволяют транспортировать субстраты в грамотрицательных бактериях.

Сигнальный пептид 1 24 Эта структура необходима для распознования белка,
который будет выделяться из клетки.

Pfam-B 22914 453 495 PB022914 Это участок из искусственно сгенерированной базы данных Pfam-B.

В моем белке повторяются одинаковые домены OEP. Это очень интересно.

На первую страницу

На второй семестр
Назад

Название домена	Начальный остаток	Конечный остаток	Идентификатор записи	Описание
OEP	27 и 233	211 и 429	PF02321	Белки этого семейства формируют трехмерные каналы: бета-тяжи во внешней мембране и альфа-спирали в периплазме. Эти каналы позволяют транспортировать субстраты в грамотрицательных бактериях.
Сигнальный пептид	1	24		Эта структура необходима для распознования белка, который будет выделяться из клетки.
Pfam-B 22914	453	495	PB022914	Это участок из искусственно сгенерированной базы данных Pfam-B.