Главная

№1.Определение торсионных углов φ, ψ и ω у десятого аминокислотного остатка белка 1W5D_BACSU


Название двугранного угла Угол определяется по координатам атомов (обращение к атому в соответствие с синтаксисом RasMol, в скобках – название атома) Данный угол описывает поворот вокруг связи Результат измерения с помощью RasMol
φ
1)GLY9:A.C (карбонильный углерод 9-го остатка цепи А)
2)GLN10:A.N (атом азота 10-го остатка цепи)
3)GLN10:A.CA (атом Calpha 10-го остатка цепи A)
4)GLN10:A.C (атом углерода 10-го остатка цепи)
Ni - Calphai
-70.09
ψ
1)GLN10A.N (атом азота 10-го остатка цепи)
2)GLN10A.CA (атом Calpha 10-го остатка цепи)
3)GLN10A.C (атом углерода 10-го остатка цепи)
4)ILE11A.N (атом азота 11-го остатка цепи)
Calphai - С
-45.50
ω
1)GLN10:A.CA (атом Calpha 10-го остатка цепи)
2)GLN10:A.C (атом углерода 10-го остатка цепи)
3)ILE11:A.N (атом азота 11-го остатка цепи)
4)ILE11:A.CA(атом Calpha 11-го остатка цепи)
Сi - Ni+1
179.51

№2.Изображение, иллюстрирующее определение угла φ

№3. Карты Рамачандрана(с помощью 2-ой стратегии)

1)

Для цепей:

2)Для пролина и глицина:


Документ Excel: "Ram1.xlsx" Документ Excel
©Eliseeva Julia