Киотская энциклопедия генов и геномов (KEGG).


1.Определение, в каких метаболических путях участвует фермент GSHR_HUMAN


В документе Swiss-Prot с описанием белка я нашла ссылку на KEGG, идентификатор гена в KEGG имеет вид hsa:2936.
Я нашла единственный метаболический путь для моего фермента. Его идентификатор hsa00480, он называется Glutathione metabolism (глютатионовый метаболизм).

2.Найдите в KEGG структурные формулы гипоксантина и аденина



  гипоксантин (hypoxanthine) C00262


  Аденин (Adenine) C00147

3. Поиск метаболических путей от одного заданного вещества к другому


Выбранная цепочка ферментативных реакций
Карта: метобализм пуринов.
Путь:Аденин -> гипоксантина
Этот путь единственный, и в нем нет промежуточных продуктов. Для наглядности я покрасила фермент, осуществляющий эту реакцию, в синий цвет.

4. Сравнение метаболических путей у разных организмов


Возможность выбранной цепочки ферментативных реакций в разных организмах
Организм Цепочка реакций возможна
(да/нет/неизвестно)		 Обоснование
Bacillus subtilis  да  присутствуют все ферменты, необходимые для осуществления цепочки реакций
Archaeoglobus fulgidus  да  присутствуют все ферменты, необходимые для осуществления цепочки реакций
Arabidopsis thaliana  нет  неизвестен ген фермента, катализирующего 1ую стадию (EC 3.5.14.2)
Homo sapiens  нет  неизвестен ген фермента, катализирующего 1ую стадию (EC 3.5.14.2)

© Julia Chudakova