Эволюционные домены. Банки Pfam и InterPro.

1.Описание доменной архитектуры белка IOLA_BACSU в соответствии с банком Pfam.

Доменная структура белка IOLA_BACSU по данным Pfam
Cхема из Pfam:
Пояснения к схеме
№	Pfam AC	Pfam ID	Полное название семейства доменов	Положение в последовательности белка IOLA_BACSU	Клан
1.	PF00171	aldedh	Семейство доменов названо по названию фермента альдегид дегидрогеназы, фермента, отщепляющего протон у альдегидного субстра.	15-477	Клан ALDH-like (CL0099), содержит 4 семейства.

2.Некоторые данные о домене aldedh из белка IOLA_BACSU.

1.Домен aldedh встречается в 86 различных архитектурах.
2.Для 28926 белков, содержащих домен, известна последовательность.
3.Для 311 разных белков, содержащих домен, определена пространственная структура (домена или всего белка).
4.seed выравнивание

3.Опиcание, как часто и в каких организмах встречаются домены из Q013C7_OSTTA по отдельности.

доменная архитектура Q013C7_OSTTA Представленность домена DUF647 (PF04884) в организмах разных таксонов

Представленность домена PF04884 в организмах разных таксонов

Таксон		Количество белков с доменом PFxxxxxx.
Эукариоты	Зеленые растения	117
	Грибы	-
	Животные	63
	Остальные эукариоты	104
Археи		-
Бактерии		-
Вирусы		-

Домен DUF647 встречается только у эукареот.

Представленность домена ArgJ (PF01960) в организмах разных таксонов

Представленность домена PF01960 в организмах разных таксонов

Таксон		Количество белков с доменом PFxxxxxx.
Эукариоты	Зеленые растения	30
	Грибы	-
	Животные	-
	Остальные эукариоты	104
Археи		43
Бактерии		1589
Вирусы		-

ArgJ встречается среди эукариот, бактерий и архей.

4.Сравнение описаний мотивов в разных банках семейств, по данным InterPro.

разметка всех мотивов 1)Самый короткий мотив IPR016160 PS00070 (277-288), он описан в банке Pfam Family.

2)Самый длинный мотив IPR010061 PTHR11699:SF27 (1-486), он описан в банке PANTHER Classification System.
3)Следующее структурные подписи интегрированы и InterPro 1t90A, 1t90B, 1t90C, 1t90D, 1t90A02, 1t90A01.
4)Границы домена Aldedch в Pfam 15-477, а в InterPro 15-477, границы такие же.