SRS.

Задание 1. Некоторые особенности белка IOLA_BASCU.

1) Альфа спираль 43-60:
ID IOLA_BACSU_15; parent: IOLA_BACSU
FT HELIX 43 60
SQ Sequence 18 AA;
KEDIDYAAQT AAEAFKTW
//
2) Бетта поворот 29-31:
ID IOLA_BACSU_13; parent: IOLA_BACSU
FT TURN 29 31
SQ Sequence 3 AA;
PAT
//
3) Бетта тяж 34-39:
ID IOLA_BACSU_14; parent: IOLA_BACSU
FT STRAND 34 39
SQ Sequence 6 AA;
VLCQVP
//

Задание 2. Описание всех записей банка трехмерных структур PDB, относящихся к белку IOLA_BASCU.

Описание.

Задание 3. Описание всех записей банка трехмерных структур PDB, относящихся к белку IOLA_BASCU.

Таблица встеречаемости в SwissProt белков из Firmicutes , имеющих функцию, сходную с функцией белка IOLA_BACSU из Bacillus subtilis

Формулировка функции белка	Строка запроса	Количество найденных документов
Дегидрогеназа	(([swissprot-Taxonomy:Firmicutes] & ([swissprot- CommentType:function] > parent )) & ([swissprot-Comment: dehydrogenase*] > parent ))	666
Дегидрогеназа MSA	((([swissprot-Taxonomy:Firmicutes] & ([swissprot-CommentType:function] > parent )) & ([swissprot-Comment:dehydrogenase] > parent )) & ([swissprot-Comment:MSA] > parent ))	40
Дегидрогеназа MMSA	((([swissprot-Taxonomy:Firmicutes] & ([swissprot -CommentType:function] > parent )) & ([swissprot-Comment:dehydrogenase] > parent )) & ([swissprot-Comment:MMSA] > parent ))	40
Дегидрогеназа MSA не фрагмент;	((([swissprot-Taxonomy:Firmicutes] & ([swissprot-CommentType:function] > parent )) & ([swissprot-Comment:MSA] > parent )) & ([swissprot-Description:dehydrogenase] ! [swissprot-Description:fragment*]))	40
Дегидрогеназа MSA и MMSA не фрагмент;	((([swissprot-Taxonomy:Firmicutes] & ([swissprot-CommentType:function] > parent )) & (([swissprot-Comment:MSA] & [swissprot-Comment:MMSA]) > parent )) & ([swissprot-Description:dehydrogenase] ! [swissprot-Description:fragment]))	40

Задание 4. Полноразмерные последовательности найденных белков в fasta формате.

Файл с последовательностями.

Задание 5. Полноразмерные последовательности найденных белков в fasta формате.

Файл.