Торсионные углы

Таблица. Измерение торсионных углов остатка His10 в белке ESTA_BACSU, цепь А

Название
двугранного
угла 		Угол определяется по координатам атомов
(обращение к атому в соответствие с синтаксисом RasMol,
в скобках - название атома) 		Данный угол описывает
поворот вокруг связи 		Результат измерения
с помощью RasMol
φ
  1. VAL9:A.C (карбонильный углерод 9-го остатка цепи А)
  2. HIS10:A.N(атом амидного азота 10 остатка цепи)
  3. HIS10:A.CA(альфа-углерод 10 отатка цепи)
  4. HIS10:A.C(карбонильный углерод 10 остатка)
Ni - C&alphai -81.20;
ψ
  1. HIS10:A.N (азот аминогруппы 10-го остатка цепи А)
  2. HIS10:A.CA(альфа-углерод 10 остатка цепи)
  3. HIS10:A.C(карбонильный углерод 10 остатка)
  4. GLY11:A.N(азот аминогруппы 11-го остатка цепи A )
Сi&alpha - Ci 168.28;
ω
  1. HIS10:A.CA (альфа-углерод 10-го остатка цепи А)
  2. HIS10:A.C (карбонильный углерод 10-го остатка цепи А)
  3. GLY11:A.N (азот аминогруппы 10-го остатка цепи А)
  4. GLY11:A.CA(альфа-углерод 11-го остатка цепи А)
 Сi - Ni+1 -179.42
Изображение, иллюстрирующее определение угла φ

Карта Рамачандрана для всех а.о.
Карта Рамачандрана для остатков пролина
Карта Рамачандрана для остатков глицина
Карта Рамачандрана для всех остатков в альфа-спиралях
Карта Рамачандрана для всех остатков в бета-листах
Значения торсионных углов остатков глицина разнообразны( φ [-130;-40], [60;120]; ψ [-180;-165], [-65;35]),что обусловлено вероятно его строением:небольшая боковая группа.
Значения углов остатков пролина наоборот находятся в узком диапозоне(φ [-65;-50], ψ [-45;-20], ),что так же скорее всего связано со строением аминокислотного остатка(пролин-иминокислота и по своей структуре отличается от обычных аминокислот).
Значения двугранных углов α -спиралей лежат в таких областях:ψ - от -65 до 55 ,φ- от -110 до -50 , в отличие от углов β-листов(φ от -160 до -80,ψ от 100 до 170).
© Нарайкина Юля 2009-2010