Практикум 1
Nudix гидролазы представляют собой семейство белков,
которые содержат характерную последовательность GX (5) EX (7) REUXEEXG (I / L / V),
комплекс Nudix. Они катализируют гидролиз различных производных дифосфат-нуклеозидов,
таких как АДФ-рибоза, NADH и dATP. Ряд Nudix гидролаз из
нескольких видов, начиная от бактерий до человека, были описаны, в том числе, в
некоторых случаях, определены их трехмерные структуры. Продукт гена Rv1700 микобактерий
туберкулеза является Nudix гидролазой, специфической для АДФ-рибозы (ADPR). Определены
кристаллические структуры МТ-ADPRase как сами по себе, так и в комплексе с субстратом, с усбстратом
и неактивированным ионом металла Gd (3+), так и в комплексе с негидролизуемым аналоговыми
ADPR и активированными ионами Mn (2+). Эти структуры, уточненные с расширением данных
резолюций между 2,0 и 2,3 А, показали, что существуют различия в последовательности связывания
остатков сайтов между MT-ADPRase и человеческого гомолога, которые могут быть эксплуатируемой
для развития противотуберкулезного препарата.
Для переключения между изображениями нажмите "Resume".
Текст скрипта доступен здесь.
| № | Имена атомов | Длина связи (Å) | Угол N-O-C (°) |
| 1 | N(96GLU)- O(92ARG) | 2,68 | 159,8 |
| 2 | N(94LEU)- O(90ALA) | 2,77 | 169,4 |
| 3 | N(92ARG)- O(88LEU) | 2,94 | 152,0 |
| Среднее | 2,80 | 160,4 | |
| 1 | N(26GLN)- O(10SER) | 2,80 | 158,4 |
| 2 | N(12GLU)- O(24ARG) | 2,84 | 155,8 |
| 3 | N(22LEU)- O(15HIS) | 2,74 | 154,9 |
| Среднее | 2,79 | 156,4 | |
На основании полученных данных могут быть продемонстрированы некоторые структурные отличимя альфа-спиралей от бета-тяжей. Альфа-спирали являются более прочными, но менее мобильными структурами.