Филогенетическое дерево

Практикумы 1-2

Отобранные бактерии

Название Мнемоника
Acidiphilium cryptum ACICJ
Agrobacterium fabrum AGRFC
Aromatoleum aromaticum AROAE
Bartonella henselae BARHE
Bordetella pertussis BORPE
Brucella suis BRUSU
Burkholderia cenocepacia BURCA


Скобочная формула дерева

(((BORPE, BURCA), APOAE), (((BARHE, BRUSU), AGRFC), ACICJ));


Изображение дерева


Ветви дерева

     Дерево содержит 4 нетривиальные ветви:

1) {BORPE, BURCA} vs {APOAE, ACICJ, AGRFC, BARHE, BRUSU}
2) {BORPE, BURCA, APOAE} vs {ACICJ, AGRFC, BARHE, BRUSU}
3) {BORPE, BURCA, APOAE, ACICJ} vs {AGRFC, BARHE, BRUSU}
4) {BORPE, BURCA, APOAE, ACICJ, AGRFC} vs {BARHE, BRUSU}


Таксоны отобранных бактерий

Название Мнемоника Таксон
Acidiphilium cryptum ACICJ Bacteria; Proteobacteria; Alphaproteobacteria; Rhodospirillales; Acetobacteraceae; Acidiphilium
Agrobacterium fabrum AGRFC Bacteria; Proteobacteria; Alphaproteobacteria; Rhizobiales; Rhizobiaceae; Rhizobium/Agrobacterium group; Agrobacterium; Agrobacterium tumefaciens complex
Aromatoleum aromaticum AROAE Bacteria; Proteobacteria; Betaproteobacteria; Rhodocyclales; Rhodocyclaceae; Aromatoleum
Bartonella henselae BARHE Bacteria; Proteobacteria; Alphaproteobacteria; Rhizobiales; Bartonellaceae; Bartonella
Bordetella pertussis BORPE Bacteria; Proteobacteria; Betaproteobacteria; Burkholderiales; Alcaligenaceae; Bordetella
Brucella suis BRUSU Bacteria; Proteobacteria; Alphaproteobacteria; Rhizobiales; Brucellaceae; Brucella
Burkholderia cenocepacia BURCA Bacteria; Proteobacteria; Betaproteobacteria; Burkholderiales; Burkholderiaceae; Burkholderia; Burkholderia cepacia complex


Таксономия нетривиальных ветвей

Нетривиальная ветвь Выделяемый таксон
{BORPE, BURCA} Отряд (Order) Burkholderiales
{BORPE, BURCA, APOAE} Класс (Class) Betaproteobacteria
{ACICJ, AGRFC, BARHE, BRUSU} Класс (Class) Alphaproteobacteria
{AGRFC, BARHE, BRUSU} Отряд (Order) Rhizobiales



Назад
© Петрова Юлия 2016