Реконструкция эволюции доменной архитектуры

Практикум 11

Выравнивание представителей домена Pfam белков с разной доменной архитектурой

     Выбранный домен: NUDIX

Информация о домене NUDIX
AC PF16705
ID NUDIX_5
Функция домена Катализирует гидролиз АДФ-рибозы и разнообразных дополнительных АДФ-сахарных конъюгат до AMP и рибозы-5-фосфат
Ссылка на страницу домена Pfam NUDIX domain
Ссылка на страницу доменных архитектур с данным доменом Архитектуры
Ccылка на выравнивание всех последовательностей, содержащих домен Выравнивание

     Далее я выбрала 2 архитектуры, включающие NUDIX_5

Описание доменных архитектур
Изображение архитектуры Число представителей Другие домены Описание доменов
110 Ank_5(PF13857)
FERM_M(PF00373
1. Анкириновый повтор представляет собой мотив из 33 остатков в белках, состоящих из двух альфа-спиралей, разделенных петлями. Они появляются в бактериальных, архейных и эукариотических белках, но гораздо чаще встречаются у эукариот.
2. В молекулярной биологии домен FERM (F для белка 4.1, E для эзрина, R для радиксина и M для мезина) является широко распространенным белковым модулем, вовлеченным в локализацию белков на плазматической мембране. Домены FERM обнаружены в ряде белков, связанных с цитоскелетом, которые ассоциируются с различными белками на границе раздела между плазматической мембраной и цитоскелетом. Домен FERM расположен у N-конца в большинстве белков, в которых он обнаружен.
7 Ank_2(PF12796)
FERM_M(PF00373)
1. То же, что и Ank_5, но немного отличается структурой - молекула более напряженная.
2. В молекулярной биологии домен FERM (F для белка 4.1, E для эзрина, R для радиксина и M для мезина) является широко распространенным белковым модулем, вовлеченным в локализацию белков на плазматической мембране. Домены FERM обнаружены в ряде белков, связанных с цитоскелетом, которые ассоциируются с различными белками на границе раздела между плазматической мембраной и цитоскелетом. Домен FERM расположен у N-конца в большинстве белков, в которых он обнаружен.



Назад
© Петрова Юлия 2016