Поиск в базах данных белков

На страничку второго семестра



  1. SRS MRS UniProt
    Более контрастное, легко читаемое оформление страницы Оформление страницы неприятное для глаз Оформление среднее
    Страница понятно, удобно структурирована Структура страницы менее удобная Структура страницы удобная
    Много информации, много наглядных иллюстраций Информации меньше, чем на SRS, UniProt, нет иллюстраций Информации много, есть иллюстрации

    1. gambusia
      gammacoronavirus
      gammaherpesvirinae
      gammalipothrixvirus
      gammapapillomavirus
      gammaproteobacteria
      gammaretrovirus
      gammaridea
    2. gammaproteobacteria
    3. 120605 записей



  3. Формулировка функции белка Строка запроса Количество найденных документов
    taxonomy - gammaproteobacteria
    all text 2-keto-myo- inositol     		([swissprot-Taxonomy:gammaproteobacteria*] & (([swissprot-AllText:2-keto-myo-*] & [swissprot-AllText:inositol*]) | [swissprot-AllText:2-keto-myo- inositol*]))
    		11
    taxonomy - gammaproteobacteria
    description - isomerase
    		 ([swissprot-Taxonomy:gammaproteobacteria*] & [swissprot-Description:isomerase*])
    		2751
    taxonomy - gammaproteobacteria
    All text - 2KMI
    		 ([swissprot-Taxonomy:gammaproteobacteria*] & [swissprot-AllText:2KMI*])
    		25
    alltext - myo-inositol°radation
    		 ([swissprot-Taxonomy:gammaproteobacteria*] & ([swissprot-AllText:myo-inositol*] & [swissprot-AllText:degradation*]))
    		1



  4. Все последовательности запроса 1 из таблицы



  5. Я нашла только одну статью, в аннотации к которой упоминается мой белок Inosose isomerase.
    Строка запроса: (([medline-Abstract:Inosose*] & [medline-Abstract:isomerase*]) | [medline-Abstract:Inosose isomerase*])


  6. Александр Александрович Нейфах работал в следующих сферах биологии:
    ядерно-цитоплазматические отношения в раннем развитии, генетический контроль синтеза белков в эмбриогенезе,
    радиационная инактивация ядер в развитии, генетика скорости эмбриогенеза.
    Строка запроса, по которой было найдено 27 статей: ([medline-Authors:ne*fakh,a.a.*] & [medline-Year#1970:1979])

© Karavaeva Julia 2009