Назад
Вперед
Краткое описание генома вируса Jingmen tick virus
Часть 1. История открытия
Впервые был описан в журнале "PNAS" учеными из Chines Center for Disease Control and prevention. Для понимания читателей устройства генома, прикрепляю схему организации вириона другого вируса с сегментированной РНК (в сети нет схем с данным вирусом) [1].Часть 2. О геноме
Jingmen tick virus является первым вирусом, у которого найдены 4 (+)-цепи РНК.Размер вириона - 70-80нм. Геном содержит 2 сегмента неизвестного происхождения (как показали исследования гомологичных последовательностей, вероятно, они родственны кДНК Toxocare caris). Скорее всего, в процессе эволюции РНК разделилась на 4 сегмента - тогда образовались NS5 и NS3 - подобные белки [2].
Часть 3. Ферменты
Метилтрансферазная активность, связывание АТР, РНК-зависимая РНК-полимераза [3].
Часть 4. Эпидемологические исследованияПредставлен в популяциях клещей родов Rhipicephalus и Haemaphysalis по всему Китаю, являясь причиной клещевого энцефалита [1].
Основные параметры генома вируса приведены в таблице 1.
| Параметр | Значение |
| Латинское название вируса | Jingmen tick virus |
| Русское название вируса | Цзинмэнский вирус клещевого энцефалита |
| Количество фрагментов в полном геноме | 4 |
| Общая длина генома (п.н.) | 11 579 |
| Количество кодируемых в геноме белков | 5[4] |
>YP_009029996.1 putative capsid protein Jingmen tick virus
MPNAKTALLLVTLVGLALGGNDKPDWEKVKLLGQQLQSGIATKNAVKVKYYAELIISEMP
TDETTYYAGLRTGQEVALTVGSAKSIVGETLNLRINQWTRAVGEYLMIDRHIPGLTLLIT
GEDVLSDLMEFGWSYRLNPSGHYPVYAATKTLPGKGGRYTGGKTYTDRYAAFYDGHVKDH
MVAIHPHQADIERMTKYEPINLVYADLTPRSIGGRLEHVLVTKGHYTIQAGKITHVWGDK
KDCETCDPDYQVFQ
1.Cегмент 1 (+)-РНК состоит из 3114bp, кодирует белок NS5-like protein (105..2849), putative membrane protein.
2.Cегмент 2 (+)-РНК состоит из 2847bp, кодирует белок putative glycoprotein (174..2438).
3.Cегмент 3 (+)-РНК состоит из 2824bp, кодирует белок NS3-like protein(117..2543).
Устройство генома Jingmen tick virus [5]
4.Cегмент 4 (+)-РНК состоит из 2794bp, кодирует белки putative capsid protein (146..907).О жизненном цикле известно крайне мало, важно подчеркнуть, что гены перекрываются.