Для работы с базами данных я выбрал белок, с которым я работал с 1 учебного семестра: калий-связывающий белок из системы ktr (идентификатор PDB 2HMV). Асимметрическая единица этого белка содержит 2 цепи (А и В). Результаты приведены в сводной таблице.
| База данных структурных классификаций | Количество доменов | Название доменов | Расположение доменов |
| SCOPe | 2 | d2hmvA1 d2hmvB1 |
A:7-140 B:7-140 |
| ECOD | 2 | d2hmvA1 d2hmvB1 |
A:7-140 B:7-140 |
| Pfam | по 2 на на каждой цепи | TrkA_N TrkA_C |
9-124 152-220 |
| CATH | 2 | 2hmvA00 2hmvB00 |
8-144 7-141 |
Все базы данных нашли первый домен, длина которого у всех почти одинаковая. И только Pham выделил на каждой цепи по еще одному домену.
Последнее обновление: 24.12.2016