Изучение файла структурных факторов


Седьмой семестр

Главная



С сайта PDB был скачен файл структурных факторов для структуры 2hmv, с которой я работал ранее.

Это файл содержит данные о рентгеноструктурном эксперименте для данного белка.

В первых трех колонках содержится информация об образующих векторах кристаллографической ячейки.

Также содержится информация о средних значениях измеренных амптитуд для каждого рефлекса, их стандартное отклонение, какие рефлексы использовались для оптимизации модели, какие значения и фазы получились при рассчете по модели.

93% использованных для построения электронной плотности структурных факторов (18913) имеют силу сигнала F/sigma >=3.

Для оптимизации модели использовалось 18326 рефлексов (90.1%).

По ряду причин в эксперименте не могут быть измерены модули всех теоретически доступных структурных факторов.

Некоторые из них: 1)амплитуды рефлексов (маленькие значения индексов рефлексов), соответствующих небольшим векторам рассеяния, не могут быть измерены из-за наличия заглушки в направлении первичного пучка рентгеновских лучей (такие как (1,1,0), (0,0,1) или (0,1,0)). 2)нет каких-то рефлексов по техническим ограничениям эксперимента (отсутствуют: (26,19,10), (41,14,0) или (38,10,16)).

Прикрепляю ссылку на файл со структурными факторами (Excel табл).


© Рябых Григорий, 2016

Последнее обновление: 29.11.2016