PSI-Blast и Prosite

Идентификатор AC:	P74518
Белок и функция:	Light-repressed protein A; фактор стимулирования гибернации рибосомы.
Из полученных ниже результатов видно: удалось получить устойчивые результаты, все сходится и семейство хорошее.

Таблица итераций:

Номер итерации	Число находок выше порога (0.005)	Идентификатор худшей находки выше порога	E-value этой находки	Идентификатор лучше находки ниже порога	E-value этой находки
1.	24	P33987.1	3e-05	Q65SX3.1	4.8
2.	28	P9WMA8.1	3e-06	Q5K2N3.3	0.15
3.	28	P24694.1	2e-20	Q0BSD5.2	0.064
4.	28	P24694.1	2e-20	Q0BSD5.2	0.15
5.	28	P24694.1	3e-20	Q0BSD5.2	0.32
6.	28	P24694.1	2e-20	Q0BSD5.2	0.18
7.	28	P24694.1	3e-20	Q0BSD5.2	0.26

Prosite:

Функция:	ENO (энолаза)
Consensus pattern:	[LIVTMS]-[LIVP]-[LIV]-[KQ]-x-[ND]-Q-[INV]-[GA]-[ST]-[LIVM]-[STL]-[DERKAQG]-[STA]
Мотив в ENO_BRADU:	ILIKvNQIGTLTET

Более строгий consensus pattern:

[IM]-L-[IV]-K-[VI]-N-Q-I-G-[ST]-L-T-E-T

Список находок по паттерну:	matchlist.list
Правильный список ENO белков:	right.list
Находок по паттерну:	278
Правильных находок:	396
True positives:	100
False positives:	178
False negatives	118

[назад]

---

© Бартыш Катя