Информация взята из бд UniProt
По запросу (taxonomy_name:"Bacteroides faecis") в бд UniProt нашлось 14 998 результатов, один из которых относится к биотин-синтазе (AC - A0A3E5G9A3, PE - Inferred from homology (функция предположена по гомологии)). Название "Мультифункциональный слитый белок" означает, что фермент имеет каталитическую активность к 2 реакциям, которые вовлечены в биосинтез биотина. Первая реакция - введение атома серы в молекулу детиобиотина (DTB) по радикальному механизму, вторая - пренос α-аминогруппы от S-аденозил-L-метионина (SAM) на 7-кето-8-аминопеларгоновою кислоту (KAPA) с образованием 7,8-диамипеларгоновую кислоту (DAPA).
Запрос 0 показывает количество генов bioB1, которые участвуют в синтезе биотина. 1 и 2 показывают количество этих же генов у бактерий и архей соответственно. Можно сделать вывод, что способность синтезировать биотин (по крайней мере при помощи bioB) в большей степени характерна для бактерий. Запрос 3 показывает количество белков (по прежднему гена bioB) с доказанным существованием у эукариот, единственный организм - A. thaliana. Запрос 4 - сколько ферментов синтеза биотина локализованы в цитоплазме. Запрос 5 поясняет, что экспериментально этот факт не показан не в одном случае. Запросы 3-5 демонстрируют, что экспериментальных данных по биотин-синтазе в данный момент немного.
Табл 1. Запросы, связанные с биотин-синтазой
Запрос | Кол-во результатов | |
0 | (gene:bioB) AND ( (protein_name:Biotin biosynthesis) (protein_name:Biotin synthase) ) | 23621 |
1 | (gene:bioB) AND ( (protein_name:Biotin biosynthesis) (protein_name:Biotin synthase) ) AND (taxonomy_name:"Bacteria") | 23061 |
2 | (gene:bioB) AND ( (protein_name:Biotin biosynthesis) (protein_name:Biotin synthase) ) AND (taxonomy_name:"Archaea") | 508 |
3 | (existence:1) AND (gene:bioB) AND (taxonomy_name:"Eukaryota ") | 1 |
4 | (cc_scl_term:cytoplasm) AND (gene:bioB) AND ( (protein_name:Biotin biosynthesis) (protein_name:Biotin synthase) ) | 264 |
5 | (cc_scl_term_exp:SL-0086) AND (gene:bioB) | 0 |
1Некоторые гены транспорта биотина названы bioB