6Z8M
Имена атомов | Длина связи (Å) | Угол N-H-O (°) |
Альфа-спирали | ||
N(065ALA)-O(061MET) | 2.78 | 158.9 |
N(063LYS)-O(059GLU) | 2.83 | 155.5 |
N(064VAL)-O(060HIS) | 2.96 | 169.4 |
Среднее | 2.85 | 162.5 |
Бета-листы | ||
N(155VAL)-O(019LYS) | 3.00 | 150.7 |
N(019LYS)-O(153LEU) | 2.86 | 159.6 |
N(153LEU)-O(017TYR) | 2.89 | 164.4 |
Среднее | 2.90 | 158.2 |
Вывод
Среднее значение длины водородной связи для альфа-спирали - 2.85 Å и 2.90 Å для бета-слоя.
Среднее значение угла для альфа-спирали - 162.5°, для бета-слоя - 158.2°.
Ожидаемые идеальные значения для длины водородной связи альфа-спирали 2.99±0.1 Å,
а для бета-слоя - 2.91±0.14 Å.[1] Для угла идеальным значением для альфа-спирали является 155±11°, а для бета-листа - 160±10°.[1]
Полученные данные близки к идеальным.
Используемая литература
[1]Hydrogen bonding in globular proteins(1984, E.N.Baker, R.E.Hubbard)