Кабан (Sus scrofa) - парнокопытное млекопитающее, относится к семейству свиней. Всеядны, преимущественно питаются растительностью, реже мелкими животными и падалью.
| число сборок генома | 23 |
| название (assembly name) | Ninghe_Sus_1 |
| AC | GCA_015776825.1 |
| уровень сборки (assembly level) | Chromosome |
| общая длина последовательности | 2,458,240,772 |
| число контигов | 1,660 |
| число скэффолдов | 70 |
| N50 контигов | 4,265,198 |
| N50 скэффолдов | 137,575,542 |
| L50 контигов | 187 |
| L50 скэффолдов | 7 |
| последовательность одного из контигов | тут |
Запрос: 4000:5000[Sequence Length] AND Inoviridae[Organism] AND complete genome.
Количество находок: 26. (25 - GenBank, 1 - RefSeq)
| АС | MT135312 |
| Таксономия | Inovirus sp. Viruses; Monodnaviria; Loebvirae; Hofneiviricota; Faserviricetes; Tubulavirales; Inoviridae; Inovirus; unclassified Inovirus. |
| латинское название | Inovirus sp. |
| TaxID | 2202560 |
| тип генома | Circular, ssDNA genome |
| хозяина вируса | Не указано |
| файл с участками генома, предположительно кодирующими белки (CDS) | тут |
Получение файла: Send to -> Coding Sequences -> Format: Fasta Nucleotide
rep_origin - ориджин репликации. Сайт инициирующий дублирование нуклеиновой кислоты, чтобы создать две идентичные копии. То есть точка начала репликации.
AC - NC_009492
D-loop - петля смещения. Область внутри митохондриальной ДНК, в
которой короткий участок РНК взаимодействует с одной цепью
ДНК, смещая исходную комлементарную цепочку ДНК в
этой области. Также используется для описания смещения
область одной цепи дуплекса ДНК на другую цепь в реакции, катализируемой белком RecA.
AC - MW257206
misc_feature - новый или редкий участок, который не попадет под описание какого-либо ключа.
AC - MN885913
mobile_element - область генома, содержащая подвижные(мобильные) элементы.
AC - EU350953
repeat_region -область генома, содержащая повторяющиеся фрагменты.
AC - AC005703
