Блоки во множественном выравнивании
Для анализа гомологии последовательностей были выбраны варианты одного из доменов фосфофруктокиназы и скачано их множественное выравнивание с сайта Pfam. В Jalview построено множественное выравнивание и найдены блоки, результат представлен на изображениях:
Обнаружено примерно 7 блоков, из первые два расположены изолированно, а остальные расположены недалеко друг от друга. Таким образом можно сделать вывод, что примерно 55% белка представлена консервативной последовательностью, и эти участки родственны у всех представленых белков. Проект Jalview, где можно рассмотреть детали.