Контакты
Ленинские горы МГУ 1, стр. 73
8-916-939-49-78
jiabicht@rambler.ru
vk.com/allweiss
8-916-939-49-78
jiabicht@rambler.ru
vk.com/allweiss
| Источник | Пояснение | |
|---|---|---|
| Функция | emboss.net | Выводит информацию об интересующих последовательностях |
| Описание | emboss.net | infoseq выводит на экран основную информацию об одной или нескольких входных последовательностей. Это включает в себя: USA, название, номер-идентификатор, тип (нуклеиновая кислота или белок), длину и т.д. |
| Использование | emboss.net | И спользуется для получения данных характеризующих последовательности
Основные типы команд infoseq с примерами представлены здесь |
Пример
infoseq sw:ybbd_bacsu -html
| USA | Database | Name | Accession | Type | Length | Organism | Description |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| sw-id:YBBD_BACSU | sw | YBBD_BACSU | P40406 | P | 642 | Bacillus subtilis (strain 168) | Uncharacterized lipoprotein YbbD (ORF1) (Precursor) |
Синтаксис:
infoseq [сокращенное название БД]:[какой-либо идентификатор БД].
| Параметр | Описание |
| -outfile | Запись информации в файл. |
| -html | Информация в виде таблицы html |
| -heading | Показывать или нет заголовки таблицы |
| -usa | Показывать USA |