Семестры Домой Проекты Обо мне

Pfam, Interpro

Доменная архитектура белка MOXC_BACSU в соответствии с банком Pfam.

Cхема из Pfam:
Пояснения к схеме
Pfam AC Pfam ID Полное название семейства доменов
Положение в последовательности белка MOXC_BACSU Клан
1. PF00296 Bac_luciferase Люциферазы - это общий термин для класса окислительных ферментов, используемых в биолюминесценции.Название происходит от распространенного имени дьявола - Люцифер.
start-15 end-385 К сожалению мой белок не принадлежит ни к одному из кланов.

Выбранный один из доменов моего белка и некоторые следующие данные о нем (Bac_luciferase)

Описание архитектуры домена

Архитектура, выбранная мной: Q47KF8_THEFY

Встречаемость доменов PF00296(Luciferase) и PF01814(Hemerythrin) таксономических группах организмов:

Таксон
Количество белков с доменом PF00296
Количество белков с доменом PF01814
Эукариоты Зеленые растения - 0
Грибы - 0
Животные 198 0
Остальные эукариоты 36 0
Археи 56 0
Бактерии 2918 1
Вирусы 3 0

Судя по полученныч данным этих доменов в совокупности нет ни в грибах, ни в зеленых растениях. Также заметно, домен Люциферазы сильно превосходит числом домен Хемиритрина. Но встречаемость обоих этих доменов преобладает в бактериях.

Сравнение описания мотивов в разных банках семейств, по данным InterPro.

Посредством БД InterPro были найдены все подписи белка MOXC_BACSU интегрированных в InterPro.

Разметка мотивов БД InterPro белка MOXC_BACSU

В InterPro интегрировна 1 структурная подпись - ALKANESULFONATE MONOOXYGENASE-RELATED(PTHR30011).

Контакты
Ленинские горы МГУ 1, стр. 73
8-916-939-49-78
jiabicht@rambler.ru
vk.com/allweiss
FBBФакультет Биоинженерии и Биоинформатики