Семестры Домой Проекты Обо мне

Работа с UniProt

Сравнение двух белков

 Метка поляБелок 1Белок 2
Код(ы) доступа ("Accession number") AC O31534 P94425
Идентификатор записи в БД ID YETG_BACSU YCNE_BACSU
Название (краткое описание) белка DE RecName:
Full=Putative monooxygenase YetG;
EC=1.14.-.-;
RecName:
Full=Putative monooxygenase YcnE;
EC=1.-.-.-;
Дата создания документа DT January 20, 2009 July 15, 1998
Дата последнего исправления аннотации DT January 9, 2013 (entry version 64) January 9, 2013, (entry version 83)
Название организма OS Bacillus subtilis Bacillus subtilis
Классификация организма OC
Bacteria;
Firmicutes;
Bacillales;
Bacillaceae;
Bacillus

Bacteria;
Firmicutes;
Bacillales;
Bacillaceae;
Bacillus
Длина последовательности ID(SQ) 108AA 95AA
Число публикаций, использованных при создании документа RN 1 4
Журнал и год самой последней публикации RL Журнал Nature в 1997 году
В базе данных: PDB data bank (JAN-2005)
Журнал Microbiolog в 1996 году [
Ключевые слова KW 3D-structure; Complete proteome;
Биологический процесс, в котором участвует белок - Antibiotic biosynthesis
Молекулярная функция - Monooxygenase;
Лиганды - Metal-binding(металл-связывающий); Iron.
Биологический процесс, в котором участвет белок - May contribute to the degradation of aromatic compounds (Aromatic hydrocarbons catabolism and Detoxification)
PTM(пострансляционная модификация) - Phosphoprotein
Молекулярная функция - Monooxygenase;
Идентификаторы записей PDB DR Отсутствует Отсутствует

Находки ортологов в Swissprot и TrEMBL

В базе даннных TrEMBL нашлось 24475 ортологов
[(Putative monooxygenase) AND reviewed:no]

В базе данных Swissprot нашлось 120 ортологов
[(Putative monooxygenase) AND reviewed:yes]

TrEMBL выдает на порядок больше резудьтатов, так как эта БД содержит белки которые "предсказаны", в то время как в БД Swissprot находятся только реально существующие последовательности

Контакты
Ленинские горы МГУ 1, стр. 73
8-916-939-49-78
jiabicht@rambler.ru
vk.com/allweiss
FBBФакультет Биоинженерии и Биоинформатики