Семестры Домой Проекты Обо мне

Сравнение мутантных последовательностей MOXC_BACSU

Мутант 1

Выравнивание мутанта №1 находится здесь
А здесь находится выравнивание в формате fasta

Парное выравнивание мутанта 1 и исходной последовательности MOXC_BACSU. Красным цветом выделены положительно заряженные аминокислоты, синим - отрицательно заряженные, фиолетовым - положительно заряженные, зеленым - с ароматическим радикалом, светло-бирюзовым - полярные, а серым - неполярные аминокислоты. Вероятность изменения остатка - 0.6, вероятность замены - 0.6

Процент идеинтичности: 4/20*100% = 20%
Процент сходства: 8/20*100%= 40%
Вес по матрице BLOSSUM62: 3

Мутант 2

Выравнивание мутанта №2 находится здесь
А здесь находится выравнивание в формате fasta

Парное выравнивание мутанта 2 и исходной последовательности MOXC_BACSU. Красным цветом выделены положительно заряженные аминокислоты, синим - отрицательно заряженные, фиолетовым - положительно заряженные, зеленым - с ароматическим радикалом, светло-бирюзовым - полярные, а серым - неполярные аминокислоты. Вероятность изменения остатка - 0.6, вероятность замены - 0.8

Процент идеинтичности: 3/20*100% = 15%
Процент сходства: 8/20*100%= 40%
Вес по матрице BLOSSUM62: 10

Мутант 3

Выравнивание мутанта №3 находится здесь
А здесь находится выравнивание в формате fasta

Парное выравнивание мутанта 3 и исходной последовательности MOXC_BACSU. Красным цветом выделены положительно заряженные аминокислоты, синим - отрицательно заряженные, фиолетовым - положительно заряженные, зеленым - с ароматическим радикалом, светло-бирюзовым - полярные, а серым - неполярные аминокислоты. Вероятность изменения остатка - 0.4, вероятность замены - 0.8

Процент идеинтичности: 9/20*100% = 45%
Процент сходства: 11/20*100%= 55%
Вес по матрице BLOSSUM62: 30



Выравнивание ортологов

Выравнивание 3 ортологов белка MOXC_BACSU(1YW1)

Выравнивание 3 ортологов по этой ссылке
А здесь находится выравнивание в формате jar

Описание работы можно посмотреть тут
Контакты
Ленинские горы МГУ 1, стр. 73
8-916-939-49-78
jiabicht@rambler.ru
vk.com/allweiss
FBBФакультет Биоинженерии и Биоинформатики