Сравнение мутантных последовательностей MOXC_BACSU
Мутант 1
Выравнивание мутанта №1 находится здесь
А здесь находится выравнивание в формате fasta
Парное выравнивание мутанта 1 и исходной последовательности MOXC_BACSU. Красным цветом выделены положительно заряженные аминокислоты, синим - отрицательно заряженные, фиолетовым - положительно заряженные,
зеленым - с ароматическим радикалом, светло-бирюзовым - полярные, а серым - неполярные аминокислоты. Вероятность изменения остатка - 0.6, вероятность замены - 0.6
Процент идеинтичности: 4/20*100% = 20%
Процент сходства: 8/20*100%= 40%
Вес по матрице BLOSSUM62: 3
Мутант 2
Выравнивание мутанта №2 находится здесь
А здесь находится выравнивание в формате fasta
Парное выравнивание мутанта 2 и исходной последовательности MOXC_BACSU. Красным цветом выделены положительно заряженные аминокислоты, синим - отрицательно заряженные, фиолетовым - положительно заряженные,
зеленым - с ароматическим радикалом, светло-бирюзовым - полярные, а серым - неполярные аминокислоты. Вероятность изменения остатка - 0.6, вероятность замены - 0.8
Процент идеинтичности: 3/20*100% = 15%
Процент сходства: 8/20*100%= 40%
Вес по матрице BLOSSUM62: 10
Мутант 3
Выравнивание мутанта №3 находится здесь
А здесь находится выравнивание в формате fasta
Парное выравнивание мутанта 3 и исходной последовательности MOXC_BACSU. Красным цветом выделены положительно заряженные аминокислоты, синим - отрицательно заряженные, фиолетовым - положительно заряженные,
зеленым - с ароматическим радикалом, светло-бирюзовым - полярные, а серым - неполярные аминокислоты. Вероятность изменения остатка - 0.4, вероятность замены - 0.8
Процент идеинтичности: 9/20*100% = 45%
Процент сходства: 11/20*100%= 55%
Вес по матрице BLOSSUM62: 30
Выравнивание ортологов
Выравнивание 3 ортологов белка MOXC_BACSU(1YW1)
Выравнивание 3 ортологов по этой ссылке
А здесь находится выравнивание в формате jar
Описание работы можно посмотреть тут