Учебный сайт Ксении Худяковой

Изначально был дан идентификатор цистеин-десульфоразы в базе Refseq Proteins. Идентификаторы этого фермента в других базах данных были определены по его идентификатору в Refseq Proteins с помощью сервиса Uniprot Retrieve/ID mapping. Полученные идентификаторы приведены в табл. 1.

База данных	Идентификатор
UniprotKB	F0LLP1 (F0LLP1_THEBM)
UniRef50	UniRef50_A0A075M044
Refseq Proteins	WP_013467116.1
PDB	-

Табл. 1.

Запись об этом белке была найдена в Uniprot. Произведено сравнение первой и последней версий данной записи. Дата создания первой версии - 2011-05-03. Последней версии (№ 25) - 2015-12-09.

Был изменен ID. Идентификатор новой версии включает мнемонику имени организма, из которогро выделили белок - Desulfotomaculum ruminis

Добавлены идентификаторы записей об этом белке в других БД.

Добавлены ссылки на достоверные источники, уточнен штамм археи.

Были найдены записи в Uniprot с гомологичными последовательностями. Для сравнения были взяты белки из следующих организмов - Desulfotomaculum ruminis (из этого организма выделили белок, соответствующий исходной последовательности), Archaeoglobus fulgidus и Ferroglobus placidus. Сравнение представлено в таблице Excel. Белок Ferroglobus placidus является предсказанным, поэтому для него не описана функция, особенности (структура, модифицированные остатки и т.п.) описаны менее подробно, чем у двух других белков. Для белка Archaeoglobus fulgidus есть структуры в базе PDB.

В записи Uniprot в разделе Fetures (FT) описаны особенности белка. Это может быть информация о содержании необычных аминокислот (пирролизина и селеноцистеина), структуре, модификациях и т.п. На рисунке представлено, как в Uniprot отображается наличие в белке селеноцистеина.