Нам предложили рассмотреть, как взаимодействуют друг с другом минералокортикоидный рецептор и его антагонист по имени EY8.
Был выбран такой антагонист, который обладает замечательным свойством - он демонстрирует эффективную защиту органов от сердечно-почечных
заболеваний и при этом не вызывает гиперкалиемию - существенных изменений соотношения Na+ /K+ в клетке.
Ниже приведены иллюстрации лигандов: пентандиола и EY8, и их взаимодействие с окружающими остатками. Ссылку на сессию можно скачать Здесь.
Рис.1 Визуализация лигандов в отображении sticks.
Рис.2 Визуализация взаимодействий лиганда EY8 с окружением. Желтым пунктиром показаны водородные связи между лигандом и аминокислотными остатками белка.
Больше всего водородных связей образовал атом азота при фосфоре лиганда. Он выступает донором водородной связи для карбонильного кислорода самого лиганда и для карбонильного
кислорода глутамина 776. А еще он выстуапет акцептором водородной связи для серина 810. Молекула хорошо закреплена своим окружением.
Рис.3 Визуализация взаимодействий пентандиола с окружением. Голубым пунктиром показаны водородные связи между лигандом и аминокислотными остатками белка.
Обе гидроксильные группы лиганда образуют водородные связи: одна с водой, другая - с лизином 873.
