Практикум №10
Для сравнения карт локального сходства, построенных Megablast и BLASTN, я выбрала бактерии Stenotrophomonas maltophilia (ID NZ_LT906480.1) и Stenotrophomonas rhizophila (ID NZ_CP007597.1).
Рис. 1. Карта локального сходства, построенная Megablast
Рис. 2. Карта локального сходства, построенная BLASTN
Результаты Megablast и BLASTN похожи, но в карте BLASTN видны серии повторов (скопления точек), которые мешают ее восприятию. Последовательности выровнялись хорошо, однако присутствуют разрывы. Это говорит о том, что в обоих геномах имели место мутации (в основном, делеции).