Практикум №9
Задание 1
| Protein name | ID 1 | ID 2 | Score | % Indentity | %Similarity | Gaps | Indels |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Adenosine diphosphoribose pyrophosphatase |
ADPP_BACSU | ADPP_ECOLI | 171.5 | 29.4% | 46.3% | 34 | 11 |
| Alpha-galactosidase | AGAL_BACSU | AGAL_ECOLI | 1066.0 | 48.6% | 63.9% | 19 | 6 |
| Guanylate kinase | KGUA_BACSU | KGUA_ECOLI | 401.5 | 41.0% | 58.1% | 9 | 4 |
Задание 2
| Protein name | ID 1 | ID 2 | Score | % identity | % Simiarity | Gaps | Indels | Coverage 1 | Coverage 2 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Adenosine diphosphoribose pyrophosphatase | ADPP_BACSU | ADPP_ECOLI | 176.5 | 32.8% | 50.5% | 20 | 9 | 95.68% | 89.47% |
| Alpha-galactosidase | AGAL_BACSU | AGAL_ECOLI | 1070.0 | 49.7% | 65.1% | 14 | 4 | 54.63% | 55.43% |
| Guanylate kinase | KGUA_BACSU | KGUA_ECOLI | 408.5 | 42.8% | 60.7% | 5 | 2 | 97.06% | 96.14% |
Задание 3
Глобальное выравнивание
| ID 1 | ID 2 | Score | % Indentity | %Similarity | Gaps | Indels |
|---|---|---|---|---|---|---|
| AGAL_BACSU | ADPP_ECOLI | 12.0 | 4.5% |
7.6% |
469 | 10 |
Локальное выравнивание
| ID 1 | ID 2 | Score | % identity | % Simiarity | Gaps | Indels | Coverage 1 | Coverage 2 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ADPP_BACSU | KGUA_ECOLI | 48.5 | 17.4% |
37.1% |
57 | 8 | 78.92% | 63.29% |
Задание 4
Были выбранa мнемоникa: ADPP_METJA, ADPP_ECO57, ADPP_SHIFL, ADPP_ECOL6, ADPP_HAEIN.
Рекомендованное полное имя белка: Adenosine diphosphoribose pyrophosphatase.
В выравнивании можно увидеть большое количество консервативных колонок, что говорит об общности происхождения взятых белков.