Краткое описание генома бактерии Bacillus pumilus SAFR-032


Рисунок 1. Клетки Bacillus pumilus.

Местообитание и особенности

Штамм бактерий Bacillus pumilus выделен из окружающей среды. Клетки штамма - крупные грамположительные аэробные палочки цилиндрической формы (рис. 1). Могут возникать скопления клеток в виде цепочек. Колонии зернистые, с выступающим плотным центром, края колоний неровные. В зависимости от условий культивирования и питательной среды колонии могут образовывать пигмент от бежевого до розового. Штам безвреден, не токсичен, не имеет плазмид, устойчив к некоторым антибиотикам. [1].

Геном

Геном данной бактерии содержит 3704641 нуклеотид. В геноме содержится 3850 генов, которые кодируют 3724 белка. Размер генома составляет 3,79 Mb. Геном секвенировали 12 июля 2016 года. [2].

Ниже приведен участок генома Bacillum pumilus SAFR-032. 
                      
 MNTQKSFDGQSDMGILYLVPTPIGNLEDMTFRAIQTLKDVDYIA 
 AEDTRQTKKLCHVYEIDTPLTSYHEHNKDSSGHKLIEWLKEGKN
 IALVSDAGLPTISDPGAEVVRDFTNIGGYVVPLPGANAALTALI
 ASGITPQPFFFYGFLDRQKKEKKKQLEALKKRQETIIFYEAPHR
 LKETLTLMKEVWGNRNIAITRELTKKFEEFIRGDLESVLTWATE
 NQIRGEFCLVVQGNDQDEEELNEEVWWKSLSEKEHVIHYIEEGL
 TSKEAIKRTAVERGVPKRTIYDAYHIEQ
А вот ссылка на сайт, где представлено описание белка данной бактерии, выданного мне для анализа.

Источники:

[1] http://www.findpatent.ru/patent/240/2405821.html
[2] https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/1005834915

© Марина Клименко, 2016