Информация о белке D-lactate dehydrogenase

Full name D-lactate dehydrogenase
Uniprot ID Q8RG11_FUSNN
Uniprot AC Q8RG11
Refseq ID WP_011016441.1
PDB ID 3WWY
Молекулярная масса 37936 MW
Длина 335 AA
Статус Unreviewed

Дополнительная информация полуенная из файла.

1. В файлах PDB структура белка представлена 2 цепями.

2. Идентификатор нуктеотидной последовательности NC_003454

3. Данный белок - фермент, гидролаза, катализирующая некоторые химические реакции ((R)-лактата + НАД+ = пируват + НАДН + Н+).

4. Ген, кодирующий белок, находится в локусе FN0511 .

5. Дата последнего изменения: 07 сентября 2016.

6. Таксокомическое положение: Bacteria - Fusobacteria - Fusobacteriales - Fusobacteriaceae - Fusobacterium.

Кластеры Uniprot для белка D-lactate dehydrogenase

Кластер Идентификатор Количество белков
UniRef50 UniRef50_E1L2D1 134
UniRef90 UniRef90_D5REA7 21
UniRef100 UniRef100_Q8RG11 1

Поиск в Uniprot

1. Поиск по рекомендованному названию

Так как для моего белка не было дано рекомендованное название, я использовала SubName. Текст запроса: name: D-lactate dehydrogenase Количество найденных белков: 7,914. Из них только 31 имеют статус Reviewed

2. Поиск по тому же названию среди белков из организмов того же семейства

Текст запроса: name:cyanuric acid amidohydrolase taxonomy:xanthobacteraceae Количество белков: 35. из них 0 со статусом Reviewed.

3. Поиск по рекомендованному названию в рамках отдела

Текст запроса: name:cyanuric acid amidohydrolase taxonomy:proteobacteria. Количество белков: 40. Из них 0 имеют статус Reviewed.

4. Поиск по названию "hemoglobin" в различных таксонах

Запрос Текст запроса Количество Reviewed
Без oграничений name:hemoglobin 8496 944
Metazoa name:hemoglobin taxonomy:Metazoa 3363 838
Vertebrata name:hemoglobin taxonomy:Vertebrata 2442 821

Поиск трипсина

1. Текст запроса: name:trypsin. Количество белков: 11134. Среди них 301 имеют статус Reviewed.

2. Текст запроса: name:trypsin name:inhibitor. Количество белков: 2791. Среди них 203 имеют статус Reviewed.


© Mischenko POlina 2016