Full name | D-lactate dehydrogenase |
Uniprot ID | Q8RG11_FUSNN |
Uniprot AC | Q8RG11 |
Refseq ID | WP_011016441.1 |
PDB ID | 3WWY |
Молекулярная масса | 37936 MW |
Длина | 335 AA |
Статус | Unreviewed |
Дополнительная информация полуенная из файла.
1. В файлах PDB структура белка представлена 2 цепями.
2. Идентификатор нуктеотидной последовательности NC_003454
3. Данный белок - фермент, гидролаза, катализирующая некоторые химические реакции ((R)-лактата + НАД+ = пируват + НАДН + Н+).
4. Ген, кодирующий белок, находится в локусе FN0511 .
5. Дата последнего изменения: 07 сентября 2016.
6. Таксокомическое положение: Bacteria - Fusobacteria - Fusobacteriales - Fusobacteriaceae - Fusobacterium.
Кластеры Uniprot для белка D-lactate dehydrogenase
Кластер | Идентификатор | Количество белков |
UniRef50 | UniRef50_E1L2D1 | 134 |
UniRef90 | UniRef90_D5REA7 | 21 | UniRef100 | UniRef100_Q8RG11 | 1 |
Поиск в Uniprot
1. Поиск по рекомендованному названию
Так как для моего белка не было дано рекомендованное название, я использовала SubName. Текст запроса: name: D-lactate dehydrogenase Количество найденных белков: 7,914. Из них только 31 имеют статус Reviewed
2. Поиск по тому же названию среди белков из организмов того же семейства
Текст запроса: name:cyanuric acid amidohydrolase taxonomy:xanthobacteraceae Количество белков: 35. из них 0 со статусом Reviewed.
3. Поиск по рекомендованному названию в рамках отдела
Текст запроса: name:cyanuric acid amidohydrolase taxonomy:proteobacteria. Количество белков: 40. Из них 0 имеют статус Reviewed.
4. Поиск по названию "hemoglobin" в различных таксонах
Запрос | Текст запроса | Количество | Reviewed |
Без oграничений | name:hemoglobin | 8496 | 944 |
Metazoa | name:hemoglobin taxonomy:Metazoa | 3363 | 838 | Vertebrata | name:hemoglobin taxonomy:Vertebrata | 2442 | 821 |
Поиск трипсина
1. Текст запроса: name:trypsin. Количество белков: 11134. Среди них 301 имеют статус Reviewed.
2. Текст запроса: name:trypsin name:inhibitor. Количество белков: 2791. Среди них 203 имеют статус Reviewed.