Частоты остатков в протеомах Azorhizorium caulinodans ORS 571 и Escherichia coli (K12)

Организм Proteome ID Число остатков Число последовательностей
Fusobacterium nucleatum subsp. nucleatum ATCC 25586 UP000002521 641087
Escherichia coli (K12) UP000000625 1356086 4306

Остаток Доля Fusobacterium nucleatum subsp. nucleatum Доля Escherichia coli (12) Разность долей
A 0,054617 0,08544 -0,030823
L 0,093395 0,09813 -0,004735
G 0,063478 0,06896 -0,005482
V 0,060893 0,06524 -0,004347
R 0,031944 0,05558 -0,023636
P 0,025519 0,04166 -0,016141
T 0,04853 0,05759 -0,00906
E 0,078693 0,05557 0,023123
S 0,05978 0,06758 -0,0078
D 0,054019 0,05242 0,001599
I 0,099625 0,06311 0,036515
F 0,049093 0,04119 0,007903
Q 0,021613 0,04156 -0,019947
K 0,101111 0,05119 0,049921
M 0,023841 0,02637 -0,002529
N 0,063879 0,04657 0,017309
Y 0,044219 0,03182 0,012399
H 0,0118 0,02223 -0,01043
W 0,006221 0,01467 -0,008449
C 0,007731 0,01314 -0,005409

Коментарий к таблице

Три наиболее часто встречающихся остатка в протеоме Fusobacterium nucleatum subsp. nucleatum ATCC 25586 - Лизин, Изолейцин, Лейцин . Для протеома E. coli - Лейцин, Аланин и Глицин. Наиболее редкими для Fusobacterium nucleatum subsp. nucleatum ATCC 25586 являются Гистидин, Цистеин, Триптофан. Для E. coli наиболее редкими также являются Гистидин, Триптофан и Цистеин. Таким образом, C, H и W - наиболее редкие для обоих организмов. Наибольшая по абсолютной величине разница в частотах наблюдается для остатков Лизина.


© Mishchenko Polina 2016