Ассимметрическая ячейка - минимальная часть белка, из которой можно восстановить весь кристалл с помощью только кристаллографических симметрий (поворота и сдвига). Биологическая единица - минимальная часть белка, способная выполнять функцию этого белка.
Пример с биологической единицей больше содержимого асимметрической ячейки
Для этого примера нужен белок, биологическая функция которого выполняется в форме димера, а асимметрическую ячейку составляет мономер. Чтобы найти такой пример, был осуществлён расширенный поиск в PDB с параметрами: Number of Chains (Asymmetric Unit) = 1, Number of Chains (Biological Assembly) = 2. Была выбрана структура 6UDV .
Функциональный димер можно получить поворотом второго мономера на 180 градусов.
Пример с биологической единицей, являющейся частью содержимого асимметрической ячейки
Для того, что бы найти такой пример, были заданы обратные параметры: Number of Chains (Asymmetric Unit) = 2, Number of Chains (Biological Assembly) = 1. Была выбрана структура 6JD4 .
