Выбрала 7 бактерий отдела Pseudomonadota: ACICJ, AGRFC, AROAE, BARHE, BORPE, BRUSU, BURMA.
Создала локальную базу данных: makeblastdb -in prot.fasta -dbtype prot
Нашла в выбранных протеомах достоверные гомологи белка CLPX_ECOLI: blastp -task blastp -query CLPX_ECOLI.fasta -db prot.fasta -out blastp.out -evalue 0.0001
Реконструировала дерево программой FastME, модель p-distance: дерево в формате Newick