Белок бактерии Aeromonas allosaccharophila

Отбор

База данных UniProtKB
Advanced search, Organism [OS]: Aeromonas allosaccharophila
Поисковый запрос выглядел так - (organism_id:656)
В результате поиска было найдено 13 570 белков
A0A7T2PEQ9 - A0A7T2PEQ9_9GAMM - Flavohemoprotein

О белке

Рекомендуемое название - флавогемопротеин. Альтернативные названия - флавогемоглобин, гемоглобиноподобный белок, NO-диоксигеназа.
Катализатор реакции окисления оксида азота до нитрат-иона атмосферным кислородом с отщеплением протона от NADH или NADPH:
2 NO + 2 O2 + NADH/NADPH = H(+) + NAD(+)/NADP(+) + 2 NO3(-)
Кофакторы - FAD и гем b.
Форма белка - глобула.
Длина цепи - 397 а. о.

Поиск ферментов, катализирующих данную реакцию

Попробуем поискать белки, катализирующие такую же реакцию. Для этого укажем условие поиска - Advanced search, (AND) Enzyme classification [EC]: 1.14.12.17 - (ec:1.14.12.17), (AND/NOT) Taxonomy [OC]: ... - AND/NOT (taxonomy_id: ...)

Поиск из всех белков по запросу (ec:1.14.12.17) - 15 989 объектов. Организмы - в большинстве бактерии и меньше протисты; среди обеих групп можно заметить возбудителей различных заболеваний человека (жиардия, чумная и коклюшная палочки, сальмонела, возбудитель пневмонии и т. д.). Также в списке были найдены кишечная палочка, дрожжи и слизневики.

Поиск среди эукариот (к поисковому запросу добавим AND Eukaryota (eucaryotes)) - 1917 объектов. Запрос - (ec:1.14.12.17) AND (taxonomy_id:2759) Из них 1691 принадлежит Opisthokonta - (ec:1.14.12.17) AND (taxonomy_id:33154), из них 172 - Metazoa - (ec:1.14.12.17) AND (taxonomy_id:33208) - 1 белок у представителя трематод, 1 - нематод, 4 - насекомых - (ec:1.14.12.17) AND (taxonomy_id:33208) NOT (taxonomy_id:10190). Остальные - у коловраток - (ec:1.14.12.17) AND (taxonomy_id:33208) AND (taxonomy_id:10190). 1518 - Fungi - (ec:1.14.12.17) AND (taxonomy_id:4751), и один у представителя ихтиоспорей - (ec:1.14.12.17) AND (taxonomy_id:33154) NOT (taxonomy_id:4751) NOT (taxonomy_id:33208).

Ещё некоторые замечания: у некоторых водорослей (эвгленовые (ec:1.14.12.17) AND (taxonomy_id:2704141) - 2, динофитовые (ec:1.14.12.17) AND (taxonomy_id:2864) - 9, охрофитовые(ec:1.14.12.17) AND (taxonomy_id:2696291) - 17, зеленые (ec:1.14.12.17) AND (taxonomy_id:3041) - 10, красные (ec:1.14.12.17) AND (taxonomy_id:2763) - 6) также встречаются катализаторы данной реакции. У высших растений не обнаружены белки с подобной каталитической функцией - (ec:1.14.12.17) AND (taxonomy_id:3193).

Оставшаяся часть (не без исключений) от всех белков принадлежит бактериям. По запросу (ec:1.14.12.17) NOT (taxonomy_id:2) NOT (taxonomy_id:2759) выдаются 44 метагеномных и белков неизвестных организмов и 7 белков архей.

Вывод о встречаемости белков-катализаторов EC 1.14.12.17: подавляющее большинство обладателей - бактерии. Среди эукариот в качестве обладателей подобных белков главным образом выступают грибы и на порядок меньше коловратки. У водорослей белки с такой ферментативной способностью встречаются еще реже.