Результаты


Задание 1

gatc-a.pdb

gatc-b.pdb

gatc-z.pdb


Задание 2


Тимин

В сторону большой бороздки обращены атомы C4, O4, C5, C7.

В сторону малой бороздки обращены атомы N1, C2, O2.

Рис. 1. Выбранное основание
Таблица
Табл. 1. Полученные результаты

Задание 3

тРНК - 1gts. Представлена A форма спирали. Неканонических пар 8.

Номера всех нуклеотид и координаты первой и последней связи стеблей приведены ниже:

  • 2 - 7 = 71-66 (43.763; 40.695; 33.941) (28.615; 35.067; 37.679)
  • 49-53 = 65-61 (26.011; 36.602; 39.821) (13.455; 41.442; 36.723)
  • 37-44 = 33-26 (21.395; -7.307; 19.139) (19.879; 10.986; 29.329)
  • 10-12 = 25-23 (24.155; 13.662; 29.518) (21.946; 19.322; 25.298)

Третичная структура поддерживается следующими парами:

  • 54=58
  • 55=18
  • 13=45
  • 14=8
  • 15=48
  • 19=56
Рис. 2. тРНК 1gts.

Рис. 3-5. Стэкинг пары. По порядку: 11 пара GU/AC 11.38 кв.Å; 12 пара UU/GA 10.96 кв.Å; 20 пара GC/AC 11.16 кв.Å.