Второй практикум

Рисунок 1. Дерево, построенное в fastme, мера эволюционного растояния - p-distance.
Рисунок 2. Дерево, построенное в fastme, используя модель MtREV.
Рисунок 3. Дерево, построенное в IQtree.

P-distance:

Сначала собаки - этот алгоритм решил выкинуть эфиопских волков из отряда canine, сказав, что лисы ближе к остальным представителям отряда.

У котов все чуть лучше, ведь представители отряда никуда не выкидывались, группируясь вместе. Однако пантеры и коты оказались в одной группе, хотя они ближе к пуме и рысе. Гепард у этого алгоритма в одной кладе с пумой. Вообщем котов этот алгоритм перепутал.

Рисунок 4. Изначальное дерево.

MtREV:

Помимо правильного распределение лис и собак и другого расположение рыси (теперь она отделяется раньше всех), особо не отличается от p-distance.

IQTree:

Помимо того, что он, как и остальные алгоритмы, упорно говорит, что коты ближе к пантерам, чем к остальным кошачим, алгоритм совпадает с изначальным деревом.