Второй практикум

Рисунок 1. Дерево, построенное с помощью таксономии.
Рисунок 2. Дерево, построенное через выравниване 12S рРНК.

При постройки дерева с помощью 12S рРНК тигр убегает к собакам. Не знаю почему. Горные львы объединились с гепардами, в остальном дерево построенно нормально.

Использование ежика правильно укоренило дерево. Дерево с бустрепом не отличается от такового без него. Неверные ветви имеют низкую поддержку, однако и некоторые правильные ветви (которые например объединяют род panthera имеют низкую поддержку

Рисунок 3. Дерево, построенное по цитохромам, с внешней группой Hemiechinus auritus.
Рисунок 4. Дерево, построенное по цитохромам, и укорененное с помощью дерева по таксономии.
Рисунок 5. Дерево с рисунка 3, но с использование bootstrap.

Мнемоники:

Panthera tigris (Tiger) - PANTI

Puma concolor (Mountain lion) - PUMCO

Felis catus (Cat) - FELCA

Panthera tigris sumatrae (Sumatran tiger) - PANTS

Panthera leo (Lion) - PANLE

Acinonyx jubatus (Cheetah) - ACIJB

Lynx canadensis (Canada lynx) - LYNCA

Felis silvestris (Wild cat) - FELSI

Vulpes lagopus (Arctic fox) - VULLA

Vulpes vulpes (Red fox) - VULVU

Canis lupus (Gray wolf) - CANLU

Canis aureus (Golden jackal) - CANAU

Canis lupus familiaris (Dog) - CANLF

Canis simensis (Ethiopian wolf) - CANSI

Hemiechinus auritus (Long-eared hedgehog) - HEMAU