Третий практикум

**Рисунок 1.** Дерево, построенное с помощью таксономии.

**Рисунок 2.** Дерево, построенное через выравниване 12S рРНК.

При постройки дерева с помощью 12S рРНК тигр (PANTI) больше не убегает к собакам. Горные львы (PUMCO) объединились с гепардами (ACIJB), в остальном дерево совпадает с построенным по таксономии.

Использование ежика (HEMAU) укоренило дерево так, что оно не отличается от изначального, постороенного по таксономии. Дерево с бустрепом не отличается от такового без него. Неверные ветви имеют низкую поддержку (объединяющая PUMCO и ACIJB, отделяющая LYNCA), однако и некоторые правильные ветви (которые например объединяют род panthera) имеют низкую поддержку. Однако даже неправильная ветвь имеет относительно высокую поддержу (65), объединяющая пантера и котов. Бутстреп лишь говорит, поддерживают ли ту или иную ветвь мутации, но это не всегда значит, что они точно совпадают с ходом эволюции.

В свою очередь, ветви, объединяющие FELSI и FELCA имеют поддержку 97, тоже верно и для PANTI и PANTS (98). Отделение собачих и кошачих также имеет верную поддержку. Верная ветвь, отделяющая лис (VULLA и VULVU) имеет низкую поддержку (45).