Идентификатор документа PROSITE (AC) |
Название мотива |
Краткое описание мотива |
Тип подписи (паттерн, профиль) |
Паттерн (регулярное выражение) |
Специфична ли подпись? |
Сколько мотивов нашлось в белке? |
PS00008 |
MYRISTYL |
Сайт N-миристоилирования |
паттерн |
G-{EDRKHPFYW}-x(2)-[STAGCN]-{P} |
неспецифична |
2 |
PS00005 |
PKC_PHOSPHO_SITE |
Сайт фосфорелирования протеинкиназы С |
Паттерн |
[ST] - x - [RK]
|
неспецифична |
2 |
PS00007 |
TYR_PHOSPHO_SITE |
Сайт фосфорилирования тирозинкиназы |
Паттерн |
[RK] - x(2) - [DE] - x(3) - Y or [RK] - x(3) - [DE] - x(2) - Y
|
неспецифична |
1 |
PS00006 |
CK2_PHOSPHO_SITE |
Сайт фосфорилирования казеинкиназы II |
Паттерн |
[ST] - x(2) - [DE] |
неспецифична |
1 |
В банке данных Prosite вводится ID белка. После чего выводятся данные по каждому индификатору документа Prosite: название мотива, его краткое описание, паттерн и т.д. В результате получилось что у dcd_ecoli не оказалось специфичных мотивов, и в роли подписи каждого выступает паттерн.