на главную страницу

Мотивы в белке DCD_ECOLI, описанные в БД Prosite


Идентификатор документа PROSITE (AC) Название мотива Краткое описание мотива Тип подписи (паттерн, профиль) Паттерн (регулярное выражение) Специфична ли подпись? Сколько мотивов нашлось в белке?
PS00008 MYRISTYL Сайт N-миристоилирования паттерн G-{EDRKHPFYW}-x(2)-[STAGCN]-{P} неспецифична 2
PS00005 PKC_PHOSPHO_SITE Сайт фосфорелирования протеинкиназы С Паттерн [ST] - x - [RK] неспецифична 2
PS00007 TYR_PHOSPHO_SITE Сайт фосфорилирования тирозинкиназы Паттерн [RK] - x(2) - [DE] - x(3) - Y or [RK] - x(3) - [DE] - x(2) - Y неспецифична 1
PS00006 CK2_PHOSPHO_SITE Сайт фосфорилирования казеинкиназы II Паттерн [ST] - x(2) - [DE] неспецифична 1
В банке данных Prosite вводится ID белка. После чего выводятся данные по каждому индификатору документа Prosite: название мотива, его краткое описание, паттерн и т.д. В результате получилось что у dcd_ecoli не оказалось специфичных мотивов, и в роли подписи каждого выступает паттерн.
©Дёмин Олег