| Идентификатор записи EMBL | Тип молекулы |
Класс данных
|
Раздел EMBL
|
Дата создания документа |
Описание
|
Длина последовательности
|
| U00096 | genomic DNA | STD | PRO | 23-FEB-2006 | Escherichia coli K12 MG1655, complete genome | 4639675 |
| AP009048 | genomic DNA | STD | PRO | 22-JAN-2006 | Escherichia coli W3110 DNA, complete genome | 4646332 |
| M90069 | genomic DNA | STD | PRO | 27-MAR-1992 | E.coli deoxycytidine triphosphate deaminase (dcd) gene, complete cds and ORF, 5' end | 1298 |
Все типы молекул одинаковые(genomic DNA), также одинаковы классы данных(STD) и разделы EMBL(PRO), даты создания естественно являются разными. Две записи(AP009048 и U00096) являются полными геномами: полный геном Escherichia coli W3110 DNA и полный геном Escherichia coli K12. Понятно, что длина последовательности полных геномов больше, чем не полных.
Для сравнения я взял запись M90069, которая не является полным геномом, и U00096- полный геноом Escherichia coli K12. Размещение гена в записи оказалось разным. Также разным получилось направление гена. В записи U00096 направление оказалось обратным, а в записи M90069-прямым.
| I | II | |
| ID записи | U00096 | M90069 |
| Начало гена в записи | 2139658 | 94 |
| Конец гена в записи | 2140239 | 675 |
| Направление гена | Обратное | Прямое |
| Примечания(последовательность гена dcd в полном геноме Escherichia coli K12 )* | atgcgtctgt gtgaccgaga tattgaagcc tggcttgatg aaggccgttt gtcgatcaac ccacgtccgc cagtggagcg tattaacggc gcgacggtgg atgtacgcct gggcaataaa tttcgtacct tccgtggtca cacggcagcg tttatcgatc tgagcggtcc caaagatgaa gtgagcgccg cgcttgaccg cgtgatgagc gatgagatcg ttctcgacga gggcgaggcg ttctatcttc acccaggaga gctggcgctg gcggtgacgc tggagtcggt gacgctgcca gccgatctgg tgggctggct ggacgggcgt tcctcactgg cgcgtctggg gctgatggtg cacgtcaccg cgcaccgcat cgatccgggc tggtctggtt gcattgtgct ggagttctac aactccggta agctgccgct ggcgctgcgt ccgggcatgt taattggtgc gctgagcttt gagccgcttt ccggcccggc ggtgcgacct tacaaccgcc gtgaagatgc gaaatatcgc aaccagcagg gcgcggtagc cagccgaatc gataaagact aa | atgcgtctgt gtgaccgaga tattgaagcc tggcttgatg aaggccgttt gtcgatcaac ccacgtccgc cagtggagcg tattaacggc gcgacggtgg atgtacgcct gggcaataaa tttcgtacct tccgtggtca cacggcagcg tttatcgatc tgagcggtcc caaagatgaa gtgagcgccg cgcttgaccg cgtgatgagc gatgagatcg ttctcgacga gggcgaggcg ttctatcttc acccaggaga gctggcgctg gcggtgacgc tggagtcggt gacgctgcca gccgatctgg tgggctggct ggacgggcgt tcctcactgg cgcgtctggg gctgatggtg cacgtcaccg cgcaccgcat cgatccgggc tggtctggtt gcattgtgct ggagttctac aactccggta agctgccgct ggcgctgcgt ccgggcatgt taattggtgc gctgagcttt gagccgcttt ccggcccggc ggtgcgacct tacaaccgcc gtgaagatgc gaaatatcgc aaccagcagg gcgcggtagc cagccgaatc gataaagact aa |
Ген-AIF1(его функция- предполагаемая внутриклеточная активация). Находится на комплиментарной цепи в промежутке 327096-351346. Ген AIF1 находится под номером 6. Экзонная структура:
<-[327096..327203]--...--[351040..351346]----
Общее число экзонов-6.