Практикум 7

Задание 1. Выбор белка

При помощи расширенного поиска Uniprot были найдены записи о белках бактерии Trichlorobacter lovleyi. Помимо таксономии я ввела слово dehalogenase, потому что в ходе своего миниобзора я случайно заметила данный фермент в FT файле. Самое интересное, что дегалогеназа была обнаружена у штамма способного восстанавливать уран, что вызвало еще больший интерес. В итоге я решила выбрать белок B3E810 без какой либо весомой причины.

Поисковый запрос выглядел следующим образом:

(taxonomy_id:313985) AND (*dehalogenase)

Было получено 14 белков

Задание 2. Информация о белке

Белок B3E810 относится к семейству дегалогеназ. Это ферменты, катализирующие удаление атомов галогенов из органических соединений. Механизм их работы предположительно связан с использованием B12 в качестве кофактора, но точной информации на этот счет пока нет.

Информация о белке B3E810

Задание 3. Кластеры похожих белков