Доменная структура белка SLT_Ecoli.

На главную>Второй семестр> Описание общей доменной структуры>Доменная структура белка SLT_Ecoli

База данных PFAM включает 7426 записей с краткой характеристикой разных семейств белковых доменов, включая их множественные выравнивания. Каждый домен в PFAM описан с помощью профиля-НММ.

Согласно базе данных PFAM в белке SLT_Ecoli существует 1 домен.

Изображение доменной структуры SLT_Ecoli:

а) имя - SLT

б) расположение - 482-602

в) идентификатор записи в PFAM - PF01464

г) Бактериальный литические трансгликозилазы разрушают муреин через разрушение ? 1,4 гликозидических связей. Escherichia coli имеет по крайней мере три различных литических трансгликозилазы: два растворимых изозима 65 Kd и 35 Kd и направляющегося к мембране фермента 38 Kd. Последовательность 65 ферментов Kd (ген slt) была определена MEDLINE:. Область приблизительно в 90 остатков расположенная рядом с C-терминалом slt может присутствовать в множестве других прокариотических белков и белков фага MEDLINE:. Эта область SLT, разделенная этими белками вовлечена в каталитическую деятельность. Наиболее консервативная часть этой области - ее оконечность N-терминала, которая содержит два консервативных серина и глутамина, может быть вовлеченна в каталитический механизм. Это семейство отдаленно связано с INTERPRO:IPR001916.

Наложение доменной структуры на пространственную структуру белка. Подпись. Красным цветом отмечен домен SLT.